TGI orientation book

From Tgi.kr

The Genomics Institute

 

Orientation Book

 

※ 이 책은 여러분이 진정으로 과학연구를 사랑하고 즐기는 연구자로 성장함에 도움을

드리고자 만들어졌습니다.

 

 

시작하기에 앞서

게놈과 생명정보 연구에 관심을 갖고 이곳까지 오신 여러분을 환영합니다.

아래의 글을 읽고 함께 생각해보는 시간을 가져보시겠습니까?

- 자발적 의지와 열정을 갖고 자신의 연구(게놈, 생정보학, 실험)를 할 준비가 되었습니까?

- 한 사람의 성인으로서, 자유의지와 책임감을 가지고 일할 준비가 되었습니까?

- 모든 분야에서 서로 소통하고, 본인이 가진 문제와 성격유형 등 모든 것을 공유하고

   그것을 함께 해결하기 위한 준비가 되었습니까?

- 홍익인간 정신과 헌법이 추구하는 자유와 만민 평등의 원칙에 입각하여 다른 구성원을

  존중하고, 연구 및 모든 관계에 성실하게 임하는 여러분이 되기를 원합니다. 그럴 준비가 되었습니까?

- 마지막으로, 게놈과 생정보학, 극질병, 극노화 분야는 인류에 도움이 되는 멋지고 훌륭한 연구입니다.

  여러분의 열정을 다 바쳐도 후회가 남지 않을 것입니다.

TGI 소개

TGI Mission & Goals

TGI (The Genome Institution)는 한국인의 게놈특성에 맞게 유전체와 생명정보학 기술을 통해 개개인의 질병진단을 위한 맞춤진단, 맞춤의학을 통해 건강증진과 더불어 노화억제에 관련하여 기술 개발을 목표로 하며 게놈데이터 생산 및 분석을 한 곳에서 처리하는 첨단 인프라를 구축하여 이를 바탕으로 게놈산업을 통해 국민건강 증진과 산업화, 대중화하여 울산의 성장동력으로 키울 기관이다.

TGI (The Genome Institution)의 Vision은 인간 및 다양한 생물의 게놈을 해독하고, 다양한 생명정보 기술을 개발하여 다양한 Contents를 개발하며, 이를 통해 게놈 연구를 활성화, 타생명공학 및 공학 분야에 기여하여, 인간 건강 및 복지를 향상 시키며, 다양한 생물 게놈정보를 활용하여 보존 및 복원, 고부가가치 생명자원을 개발 할 vision을 가지고 있다.

경영이념 

4대 철학 

 

   헌법경영 : 게놈연구소는 법치주의에 기반한 대한민국 헌법정신에 입각하여

                   바르고, 정의롭고, 정직하며, 정확하게, 모든 구성원들이 경영에 참여할

                   것을 원칙으로 한다.

 

   홍익인간 : 게놈연구소의 모든 조직원은 헌법상 명시된 보편적 가치인 홍익인간을

                    추구하는 경영을 한다.

 

   과학원칙 : 모든 의사결정과 판단의 기본 원칙은 과학적 데이터, 정보에 기반한

                     이성적 판단에 근거한다.

 

   실용원칙 : 게놈연구소의 모든 구성원은 실용적 성과를 도출하기 위해 노력하고,

                     산업경쟁력을 높이는 절차를 구현한다.

 

경영의 8원칙 

TGI 경영은 ISO(International Organization for Standardization) 9001을 근거한 다음의 8원칙을 고수한다.

전원참여 (Teamwork) : 모든 계층의 구성원들은 연구소의 필수 요소이다.

어떤 일이든 전원이 참여 및 배려를 하여 그들의 능력이 연구소의 발전을 위하여 발휘되도록 한다.

고객중심 : 게놈연구소는 고객에 의존하고 있다. 따라서 현재 및 미래의 고객 요구를 이해하고, 고객 요구사항을 충족시키며 고객의 기대를 능가하도록 노력할 것이다.

상호 유익한 공급자 관계 : 연구소와 공급자는 상호의존적이며 상호이익이 되는 관계를 유지하여 가치를 창조하기 위한 양쪽 모두의 능력을 증진시키도록 한다.

경영에 대한 시스템 접근방식 : 상호 연계된 프로세스를 하나의 시스템으로 파악하고 이해하며 관리하는 것은 조직의 목표를 효과적이며 효율적으로 달성하는데 이바지 한다.

프로세스 접근방식 : 관련 자원 및 활동이 하나의 프로세스로 관리될 때 바라는 결과가 보다 효율적으로 얻어진다.

지속적 개선 : 총체적 성과에 대한 지속적 개선은 연구소의 영구적인 목표이다.

사실에 근거한 의사결정 : 효과적인 결정은 데이터 및 정보의 분석에 근거하도록 한다.

리더십 : 연구소장은 연구소의 목적과 방향의 일관성을 확립한다. 구성원이 공동의 모교를 달성하는데 전적으로 참여할 수 있도록 내부 환경을 조성하고 유지한다

ISO Website : www.iso.org

ISO Videos : www.youtube.com/PlanetISO

TGI Roles

1) "개인게놈학"으로서 개인의 유전자 정보를 수지비하여 데이터를 해독하고 정보분석을 하여 개인의 유전적 특성에 맞게 맞춤의학

2) 동, 식물, 해양식물 등 유전정보를 활용하여 종 보존 및 우량 종 선별 등 생명자원 개발

3) 유전제 분석 기술 등 연구 인프라 확보를 함으로써 유전체 연구를 통해 국민건강을 증진할 수 있으며 시너지 창출효과 기대

 

TGI History

TGI는 재단법인 게놈 연구재단 (Genome Research Foundation;GRF) 설립아래 박종화 이사장의 울산과학기술원 생명공학과 교수를 임용(2014년 8월)과 함께 울산과학기술원 소속으로 설립된 연구기관인 동시에 TGI는 GRF의 실질적, 핵심적인 역할을 하고 있다.

 

조직 및 구성원 소개

조직도 ( '15. 3월 기준)

 

구성원 및 연락처 ( '17. 6월 기준)

순번

소속

성명

이메일

비고

1

게놈연구소

박종화

jongbhak (at) gmail.com

소장

2

이세민

seminlee (at) gmail.com

부소장

3

실험

연구원

김창재

kchangjae (at) gmail.com

 

4

김연경

yk1107kim (at) gmail.com

 

5

연구원

박승구

seung9park (at) gmail.com

 

6

조주옥

juokcho (at) gmail.com

 

7

김정안

vitastar (at) hanmail.net

 

8

김병철

bcghim (at) gmail.com

 

9

심정애

jungaeshim (at) unist.ac.kr

 

10

전미애

guam80 (at) gmail.com

 

11

학생

연구원

김학민

howmany2 (at) gmail.com

 

12

전성원

jsw0061 (at) gmail.com

 

13

전연수

brain0106 (at) gmail.com

 

14

박영준

youngjune29bhak (at) gmail.com

 

15

장진호

jjh2379 (at) unist.ac.kr

 

16

행정

연구원

박예신

yeshin9544 (at) gmail.com

 

17

홍수지

hongsuji209@gmail.com

 

18

전미영

myjeon243 (at) gmail.com

 

 

 

<mailling list>

tgi@biolist.org

tgi_researcher@biolist.org

tgi_wetlab@biolist.org

 

주요 연구성과

게놈 연구소는 차세대 유전체 기술(전장 유전체, 전사체, 후성 유전체, 미생물 유전체, 타겟 유전체)과 생명정보 분석 기술(클라우딩 컴퓨터 기술, 선도 유전체 해독 기술, SNP 제노타이핑 및 분석 기술)을 가지고

아래와 같은 프로젝트를 진행하였다.

동물 게놈 프로젝트


   호랑이 표준게놈

    - 연구목표 : 멸종위기종인 호랑이의 종 보전 및 게놈연구 촉진을 위하여 호랑이 표준게놈지도를 작성

    - 수행기간 : 2010년~2013년

    - 참여기관 : 국제 컨소시움, 테라젠이텍스, 게놈연구재단, BGI

    - 주요성과 : 세계최초의 호랑이 표준게놈 작성

 

 <논문발표 : Nature Communications>

 <언론보도 : BBC Science&Enviroment>

 <논문발표 : Cell, Current Biology>

 <언론보도 : 국내주요 일간지>

 

   복제개 게놈

    - 연구목표 : 세계 최초의 복제 개 스너피와 기증견(타오)의 게놈 일치여부를 Whole Genome 수준에서 비교

    - 수행기간 : 2012년

    - 참여기관 : 게놈연구재단, 테라젠이텍스, 서울대 수의대

    - 주요성과 : 복제동물의 게놈 일치성 증명(일란성 쌍둥이 수준)

 

 <사진자료 : 복제개 스너피와 기증견 타오>

 <논문발표 : Scientific Reports>

 

 

   고래게놈 프로젝트

    - 연구목표 : 세계 최초의 고래게놈 표준지도 구축

    - 수행기간 : 2011년 ~ 2013년

    - 참여기관 : 한국해양과학기술원, 테라젠이텍스, 게놈연구재단및 국제 컨소시움

    - 주요성과 : 최초의 대형고래의 게놈의 표준을 제공하여, 전 세계 고래게놈연구의 가장 중요한 인프라를 구축함.

 

 <한국해양과학기술원 공시자료1>

  <한국해양과학기술원 공시자료2>

 

 독수리게놈 프로젝트

 - 연구목표 :

 - 수행기간 :

- 참여기관 :

- 주요성과 :

 

인간 게놈 프로젝트


   한국인 개인게놈프로젝트(KPGP: Korea Personal Genome Project)

    - 연구목표 : 한국인 5,000만명 게놈분석 프로젝트

    - 수행기간 : 2008년 ~ 현재

    - 참여기관 : Univ. Harvard, 게놈연구재단, 테라젠이텍스, 유니스트 게놈연구소

    - 주요성과 : 일반 한국인 수십 명 게놈의 전체 서열을 해독하고 분석

 

 <KPGP 공식 웹사이트 1>

  <KPGP 공식 웹사이트 2>

 

 

 

   한국인 표준 게놈 지도 작성 프로젝트

    - 목적 : 한국인 표준게놈 신규제정 및 백인표준 게놈과 차이점 분석

    - 수행기간 : 2006~ 현재

    - 참여기관 : 국가생명연구자원정보센터, 테라젠이텍스, 게놈연구재단, 유니스트 게놈연구소,

    - 주요성과 : 한국 최초로 정밀한 표준게놈 구축

 

 <한국인 게놈지도 작성 프로젝트>

 

   범아시아 게놈 프로젝트(PAPGI: Pan Asian Population Genomics Institute)

    - 목적 : 범아시아 전체의 인간 다양성을 유전 지도화

    - 수행기간 : 2010 ~현재

    - 참여기관 : 게놈연구재단, 유니스트 게놈연구소, 인간게놈위원회(HUGO)

 

 <PAPGI 공식 웹사이트>

    - 주요성과 : 아시아 최초, 수백 명 아시아인의 게놈 정보를 비교분석하여 아시아인의 대륙이동 경로와 유전적 다양성 정밀 비교

 

인프라 구축


   수퍼컴퓨터를 활용한 바이오데이터 분석 인프라 (BioInfrastructure)

      - 게놈 및 생명정보 분석의 가장 중요한 도구인 고성능 컴퓨터를 교내 학술정보관 슈퍼컴퓨팅 센터에 설치하여 연구 및 운영

   BioOS

      - 생정보학을 원활히 수행하기 위한 생정보학 운영 시스템을 구축

   BioEngine

      - 생정보학의 다양한 알고리듬을 총체적으로 합쳐서 자동화된 시스템을 구축함.

   GenomeEngine:

      - 대용량 게놈의 신속한 분석을 위하여 게놈분석 파이프라인 총합 구축

 

프로젝트 현황

수행중 프로젝트

 극노화(Reversing Aging)

      - 노화연구 분류체계 (GeroClassification)

        - 노화 관련 유전자

        - 항노화 물질 발굴

        - 노화 측정기술발

 

 극질병(Elimirating Disease)

      - 암게놈연구

 

 오믹스(Omics)

      - 단백체학, 전사체학, 형질체학등의 다양한 분석

        - 다중오믹스 연구 (우울증 관련 과제수행)

 

 생정보학(Bioinformatics)

      - 생명정보처리 인프라 구축

 

 Computing Research

      - 수퍼컴퓨터 서버 구축 연구

 

 상용화

      - 벤처창업(㈜제로믹스)을 통한 보유기술 상용화 추진

 

 

Step by Step 가이드

TGI Human Relationship

TGI 내에 인간관계의 규칙은 대한민국 헌법에 기초한다. 특히 제 2장 국민의 권리와 의무 (제 11조 : 모든 국민은 법 앞에 평등한다. 누구든지 성별, 종교 또는 사회적 신분에 의하여 정치적, 경제적, 사회적, 문화적 생활의 모든 영역에 있어서 차별을 받지 아니한다. 사회적 특수계급의 제도는 인정되지 아니하며, 어떠한 형태로도 이를 창설할 수 없다. 훈장등의 영전은 이를 받은 자에게만 효력이 있고, 어떠한 특권도 이에 따르지 아니한다) 헌법에 따라 평등권을 준수한다.

 

   자기소개 및 지켜야 할 예의

      ① 서로에 대한 존중과 존경의 의미로 모든 호칭은 직함이 아닌 “○○씨”를 추천합니다.

※ ‘표준국어대사전’ 풀이에 따르면, “○○씨”라는 호칭은 ‘성년이 된 사람의 성이나 이름아래에 쓰여 그 사람을 높이거나 대접하여 부르는 말’입니다. 흔히 동료나 아랫사람에게 사용하고 윗사람에게는 사용하지 않는 것으로 생각하기 쉽지만, 연구소에서는 나이, 직급, 학력에 관계없이 모두 평등한 관계이므로, 이러한 취지로 추천합니다. 취지는 누구나 자신의 의사를 자유롭게 말하고 질문, 토의를 하는 실용적인 것입니다.

 

      ② TGI 구성원으로서 자신의 연구분야와 간단한 신상을 아래의 이메일로 소개합니다. 자기소개는 MBTI 성격유형 검사를 실시하고 그 결과를 간단하게 언급합니다.

※ MBTI 성격유형검사는 교내 “학생상담헬스케어센터(대학본부 지하 1층)”에서 무료 진단 서비스를 제공하고 있습니다.(http://counsel.unist.ac.kr/index.sko)

 

 

 

구분

메일링리스트

비고

연구원

tgi_researcher@biolist.org

 

연구원 및 학부생 연구원 tgi@biolist.org  

Genome wet Lab

tgi_wetlab@biolist.org

 

 

 

 

     

 

 

* MBTI를 하는 이유는 상호협력에서 자기와 상대를 파악하는 도구의 하나일 뿐입니다.

 

      ③ Skype 계정등록 : 본인의 Skype 계정을 생성하고, 기존 구성원과 메신저를 활용한 논의가 가능하도록 채널을 열어둡시다. 이메일은 때로는 단절과 오해를 불러일으킬 수 있습니다. 필요시에는 메신저로 활발하고 생동감 있는 소통을 할 수 있도록 환경을 조성합니다.

 

      ④ KRI회원가입 및 연구자등록번호 발급 : KRI(한국연구업적통합정보)시스템에 회원가입을 하고, 연구자등록번호를 발급받아서 관리자에게 알려주도록 합니다.

 

 

TGI Researchers' Attitude

TGI의 멤버들은 다음과 같은 자세로 연구에 임하며 빠르게 발전하는 생명공학에 글로벌한 마인드로 항상 관심을 가진다.

- 애국심을 바탕으로 한 규칙에 대한 정확한 이해

- 학문에 대한 깊은 성찰과 철학, 정직함

- 독립적인 사고와 추진 그리고 그에 따른 책임감

- 생물학적 문제에 대한 관심과 열정

- 문제해결에 대한 자신감과 편안감

 

TGI Working Process Guideline

   업무처리 가이드 라인

      ① Self-OJT 실시 : 기존의 구성원이 하는 연구와 그들을 개인적으로 만나보는 일은 여러분의 TGI 적응에 큰 도움이 될 것입니다. 본인의 일정과 자유의지에 따라서 멤버들을 개별적으로 만나도록 추천드립니다.

 

      ② 일하는 방법

         - 주 1회 이상은 업무협의 또는 회의를 통해 소통을 하도록 추천합니다.

         - 연구 중에 어려움이 있으면 주변 동료와 선행연구자에게 문제의 포인트들을 소개하고 같이 팀워크를 위한 적극적인 소통을 합시다.

         - 연구소를 즐겁고 재미있는 곳으로 만들기 위해서 서로 존중하고 노력하는 마음의 태도를 가집시다.

 

       ③ 연구하는 방법 : (공부하는게 아님 : 문제를 해결함)

         - 연구는 여러가지 논문을 미리 읽고, 도구들을 습득하고, 프로그래밍을 다익히고, 많이 준비하고, 착실하게 공부를 해놓고, 그 다음에 이런게 다되면, 본격적으로 데이터를 만들어서 나중에 데이터를 잘 정리해서

            논문을 정리해서 하는게 아닙니다.

          - 어떤 연구문제를 랩에서 시작하는 첫날부터 본격적으로 해결합니다.

          - 여러 기술이나 도구는 필요에 의해서 즉시 찾아서 익히는 것입니다.

 

 

TGI Resources

TGI에 관한 구체적인 사항은 다음의 TGI open free online site를 통해 Current events, Projects 등을 알 수 있다. 특히 open free site의 Genomics에 관한 심층적이고 다양한 정보 공유는 Genomics에 빠른 이해를 돕고자 하며, 모든 분의 참여 활동을 통해 다양한 아이디어를 서로 유발하기를 기대한다.

http://thegenomicsinstitute.org/index.php/Main_Page

<TGI open free online site에 정보 추가 및 링크 방법>

1) TGI site(위 주소) 가서 로그인을 한다. => ID : s, PW : SS

2) 주소창에 커서를 두고 Main_Page를 지우고 쓰고 싶은 주소를 영문으로 친다

    => http://thegenomicsinstitute.org/index.php/DNA

         (DNA라는 페이지를 만들고 싶은 경우)

3) Enter를 누르고 DNA페이지가 생기면 그 상태에서 Main_Page에서 edit을 누른다.

4) DNA 페이지를 링크하고자 하는 위치에 건다.

    => 링크하고자 하는 위치 : 유전자[[DNA["유전자"]]

5) 거장하면 유전자라는 위치에 DNA 페이지가 링크 된다.

* TGI open free online site에 정보 공유에 대한 어려움이 있으면 유전자 분석팀에게 문의

 

기타 정보

 

대한민국 헌법 전문

 

서버 및 연구장비 현황


   서버현황

  • 연산용, 웹서버, 메일서버, 백업용 등 다양한 용도로 사용되는 총 20여대의 서버를 보유하고 있습니다.
  • 각 서버는 게놈 분석 및 연구를 하기에 충분한 연산 성능을 갖추고 있습니다.
  • 막대한 오믹스 데이터를 저장할 수 있는 충분히 큰 저장용량을 보유하고 있습니다.